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微生物多样性-Miseq

      采用第二代高通量测序平台MiSeq,对核糖体RNA高变区域,比如16SrDNA/18SrDNA/ITS等序列,或功能基因,比如细菌和古菌的氨氧化酶基因进行测序,揭示环境样品中众多不同类型微生物种属关系,获得特定样本中的微生物多样性信息。


      MiSeq测序仪具有样品制备迅速、测序时间快(8小时内)、测序总长长的特点,能 在短时间内获得高质量测序结果。同时,Miseq测序仪整合了簇生成、SBS测序和完整的数据分析,而不再需要配置辅助性硬件。每次反应可以产生6G以上 的数据,测序读长可达到2×250bp,使每个样品的测序量达到普通测序的几百倍,而单条序列的测序费用远低于普通测序。基于以上特点,Miseq逐步被 广泛应用于环境微生物多样性研究。
      
      根据客户提供的样本(环境样本、基因组DNA、PCR产物)及需要检测的微生物多样性类型(细菌、古菌、真菌、功能基因),利用Miseq测序平台对目的片段进行高通量测序,并对测序结果进行生物信息学的分析。


      检测样品:
      样品种类:土壤、海洋、污泥、动物肠道、水样等
      样品形式:环境样品、基因组DNA、PCR产物
      检测种类:细菌、真菌、古菌、功能基因等 样品要求:
      样品类型:DNA或PCR产物
      样品量:≥500ng或≥100ng
      样品浓度:≥10ng/μL或≥5ng/μL
      样品纯度:OD260/280=1.8-2.0,无降解
      样品切忌反复冻融,冰袋或干冰运输
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