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微卫星分析STR SSR

      微卫星标记(microsatellite),又称为短串联重复序列(simple tandem repeats,STRs),是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列,由2~6个核苷酸的串联重复片段构成,由于重复单位的重复次数在个体间呈高度变异性并且数量丰富,因此微卫星标记的应用非常广泛。现已被应用于品种鉴定、亲缘关系分析、遗传杂交育种、绘制染色体遗传图谱等诸多方面。

      微卫星位点通常通过PCR扩增,扩增产物通过电泳分析并根据大小分离等位基因进行检测。我公司通过荧光标记的PCR引物扩增微卫星位点区域序列,采用ABI 3730XL Analyser同时对96个样品的荧光PCR产物进行毛细管电泳检测,30分钟-2小时之内完成微卫星位点区域的序列大小及微卫星位点数量的检测工作,为客户提供详细的微卫星位点信息,最大程度的为客户提供方便快捷的技术服务。

      SSR引物开发

      SSR/STR 是一种优秀的分子遗传标记,已经广泛应用到遗传多样性检测、遗传种质鉴定、遗传连锁图谱构 建、基因定位与标记辅助育种等多个领域。但SSR 标记应用的前提是根据物种已知DNA 序列设计特异引物,才能进行PCR 扩增。

      对于大多数物种而言,目前获得的基因组DNA及表达的cDNA 序列还非常有限或者根本没有,无法根据序列设计SSR位点引物,从而阻碍了科研的进行。

      磁珠富集法作为一种极具有效的引物开发技术,其原理是先用生物素标记重复序列特异探针并与基因组DNA 酶切片段杂交,再利用生物素与链亲和素亲和性强的特性,用包被链亲和素的磁珠进行磁力吸附完成重复序列目标片段的富集。经过磁珠富集后使克隆测序量大幅下 降且使获得具有重复序列的片段的效率大幅度提高,并用荧光引物对其多态性进行验证。磁珠富集法成为 SSR 引物开发极其有效的方法而迅速得到广泛应用。

      点击如下链接下载STR信息登记表:

      

download: STR信息登记表.docx

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