高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation" sequencing tech- nology)，以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志，同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序(deep sequencing)。

      目前，主要的高通量测序平台为罗氏454高通量测序平台和Illumina高通量 测序平台,能够进行动植物基因组测序、微生物基因组测序、宏基因组测序、 转录组测序、小RNA测序、基因表达谱分析等。 

      动植物基因组de novo测序
      动植物基因组重测序
      转录组测序基因表达谱分析
      Small RNA 深度测序
      简化基因组测序
      全基因组甲基化测序微生物基因组测序
      细菌基因组测序
      真菌基因组测序
      环境微生物群落多样性分析
      宏基因组测序
      原核生物转录组测序

      链特异性转录组测序